Gene und Stammbäume
Ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik
Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen - beide üben Faszination aus, halten aber viele Interessenten auf respektvolle Distanz. Die Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff...
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Produktinformationen zu „Gene und Stammbäume “
Klappentext zu „Gene und Stammbäume “
Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen - beide üben Faszination aus, halten aber viele Interessenten auf respektvolle Distanz. Die Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff Bioinformatik belegt. In der Tat hat die Synthese von zwei unabhängigen Disziplinen selten so viele faszinierende neue Einsichten geliefert.Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will das neue Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC und das Internet.Einführende Kapitel in die Molekularbiologie, in Evolution, Taxonomie und Kladistik, in Computerprogramme zur Sequenzverwaltung und für molekulare Phylogenetik ermöglichen je nach Wissenshintergrund den schnellen Einstieg. Wer schon etwas weiß, dem wird in einem speziellen Kapitel der direkte Weg zum Stammbaum aufgezeigt. Und wer es genau wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Likelihood und natürlich auch die neuen Bayesianischen Verfahren. Alles wird "hands on" anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen werden kann (BioEdit, Clustal, MEGA, MrBayes, PAML, PAUP, SplitsTree oder TreePuzzle).Das neue Buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis, um auch wirklich zu greifbaren Ergebnissen zu kommen. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichenIndex.
Gene, Genome und Sequenzen auf der einen Seite, Algorithmen, Computer und Informatik auf der anderen - beide üben Faszination aus, halten aber viele Interessenten auf respektvolle Distanz. Die Schnittstelle der Bereiche ist mit dem modernen Begriff Bioinformatik belegt. In der Tat hat die Synthese von zwei unabhängigen Disziplinen selten so viele faszinierende neue Einsichten geliefert.
Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will das neue Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC und das Internet.
Einführende Kapitel in die Molekularbiologie, in Evolution, Taxonomie und Kladistik, in Computerprogramme zur Sequenzverwaltung und für molekulare Phylogenetik ermöglichen je nach Wissenshintergrund den schnellen Einstieg. Wer schon etwas weiß, dem wird in einem speziellen Kapitel der direkte Weg zum Stammbaum aufgezeigt. Und wer es genau wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Likelihood und natürlich auch die neuen Bayesianischen Verfahren. Alles wird "hands on" anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen werden kann (BioEdit, Clustal, MEGA, MrBayes, PAML, PAUP, SplitsTree oder TreePuzzle).
Das neue Buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis, um auch wirklich zu greifbaren Ergebnissen zu kommen. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index.
Eine spannende Teildisziplin der Bioinformatik ist die Molekulare Phylogenetik, deren Ziel die Rekonstruktion von Stammbäumen aus molekularen Daten ist: Computer, moderne Molekularbiologie und Kladistik haben der etwas angestaubten biologischen Systematik und Taxonomie eine ungeahnte Renaissance verschafft. Der Einstieg in beide Welten gleichzeitig - Molekularbiologie und Phylogenetik - ist nicht unbedingt einfach. Hier will das neue Buch eine Lücke schließen. Die molekularen Datenbanken sind öffentlich und die notwendige Software fast immer kostenlos - man braucht nur PC und das Internet.
Einführende Kapitel in die Molekularbiologie, in Evolution, Taxonomie und Kladistik, in Computerprogramme zur Sequenzverwaltung und für molekulare Phylogenetik ermöglichen je nach Wissenshintergrund den schnellen Einstieg. Wer schon etwas weiß, dem wird in einem speziellen Kapitel der direkte Weg zum Stammbaum aufgezeigt. Und wer es genau wissen will, bekommt detaillierte Einführungen in die wichtigen methodischen Ansätze: Parsimonie, Distanzverfahren, Likelihood und natürlich auch die neuen Bayesianischen Verfahren. Alles wird "hands on" anhand von nachvollziehbaren Beispielen mit der gängigen Software besprochen, die aus dem Internet bezogen werden kann (BioEdit, Clustal, MEGA, MrBayes, PAML, PAUP, SplitsTree oder TreePuzzle).
Das neue Buch bietet so eine ideale Balance zwischen Theorie und Praxis, um auch wirklich zu greifbaren Ergebnissen zu kommen. Es hat zahlreiche Illustrationen, bietet am Ende der Kapitel Hinweise zum Weiterlesen und schließt mit einem Glossar und einem umfangreichen Index.
Inhaltsverzeichnis zu „Gene und Stammbäume “
1 Die Molekularen Grundlagen des Lebens1.1 Gene und Genome, Nukleotide und DNA
1.2 Der genetische Code
1.3 Die Proteinbiosynthese
1.4 Genome in Kern, Mitochondrien und Chloroplasten
1.5 Molekulare Besonderheiten
1.6 Aus der Werkzeugkiste der Molekulargenetik
1.7 Leseempfehlungen
2 Evolution, Taxonomie und Phylogenie
2.1 Evolution
2.2 Taxonomie
2.3 Phylogenetik
2.4 Molekulare Phylogenetik
2.5 Vom Alignment zum Stammbaum
2.6 Leseempfehlungen
3 Datenbanken, Molekulare Sequenzen, Programme
3.1 Die öffentlichen Datenbanken für molekulare Sequenzdaten
3.2 Suchstrategien in Datenbanken
3.3 Sequenzverwaltung und Alignments
3.4 Integrierte Programmpakete für die phylogenetische Analyse (MEGA, PAUP , PHYLIP)
3.5 Speziellere Anwendungen in phylogenetischen Analysen
3.6 Graphische Baumdarstellungen
3.7 Anwendungen im WWW
3.8 Leseempfehlungen
4 Ein schneller Weg zum Stammbaum
4.1 Die wichtigen Software-Pakete im Vergleich
4.2 Leichter Einstieg mit MEGA
4.3 Arbeiten mit PAUP
4.4Leseempfehlungen
5 Parsimonieanalyse
5.1 Das Parsimonieprinzip
Autoren-Porträt von Volker Knoop, Kai Müller
Prof. Dr. Volker Knoop (geb. 1963) hat in Berlin Biochemie studiert und dort am Institut für Genbiologische Forschung und später an der Universität Ulm gearbeitet. Er ist seit 2002 Leiter der Abteilung Molekulare Evolution an der Universität Bonn und Gründungsdirektor des dortigen IZMB, des Instituts für zelluläre und molekulare Botanik. Seine wissenschaftlichen Interessensgebiete sind die Besonderheiten in der mitochondrialen DNA der Pflanzen und die Stammesgeschichte der frühesten Landpflanzen.Dr. Kai Müller (geb. 1975) war wissenschaftlicher Mitarbeiter am Nees-Institut für Biodiversität der Pflanzen der Universität Bonn und arbeitet zurzeit am Department of Biology der Penn State University. Zu seinen Forschungsschwerpunkten gehören die Stammesgeschichte diverser Blütenpflanzengruppen, die Evolution nicht-proteinkodierender DNA-Regionen, und bioinformatische Fragestellungen, einschließlich der Entwicklung von Methoden und Programmen.
Bibliographische Angaben
- Autoren: Volker Knoop , Kai Müller
- 2006, X, 310 Seiten, mit Schwarz-Weiß-Abbildungen, Maße: 24,5 cm, Kartoniert (TB), Deutsch
- Verlag: Spektrum Akademischer Verlag
- ISBN-10: 3827416426
- ISBN-13: 9783827416421
Rezension zu „Gene und Stammbäume “
"V. Knoop und K. Müller haben ein hervorragendes Einsteigerhandbuch mit sehr viel Engagement und didaktischem Können produziert, das alle wichtigen Themen berücksichtigt und das man gerne lesen mag. Es gibt einen kompetenten Überblick über die molekulare Systematik und Phylogenetik. Gene und Stammbäume sollte man allen ans Herz legen, die sich mit dieser wichtigen und zukunftsweisenden Materie wissenschafltich beschäftigen wollen." - Physik in unserer Zeit
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